在其后的三个月治疗中持续有凉气、冷汗从机体内排出，平均2周可增长不同部位的肌围1 cm，体重增加1公斤。排泄多的部位和个人，肌肉增长迅速，机体功能恢复快，活动能力明显提高。此期病人大约经过1-8个月的治疗，基本恢复正常的肌肉组织和功能，体力、活动能力及耐力接近正常人，可达到正常和恢复部份工作的能力。此时病情已经完全控制和稳定，但仍需避免过度劳累，饮酒、吸烟，禁止食用生冷刺激性食物，保持低脂肪高蛋白、大量维生素的饮食结构，尽量不用镇静及安眠药物，减少多种精神因素刺激，使病情能进一步达到完全康复，巩固疗效。

晚期的病人，一般病程在5年以上（指东南亚地区），此期病人神经肌电图检查已无明显刺激波形及活动电位的产生，椎体内工神经传递功能和肌力已基本全部消失。肌肉活检病理几乎无完整肌纤维伴在，大部或全部为结缔组织和脂肪组织浸润。病人全身肌肉基本完全萎缩，包括肋间肌、胸大肌，各部位均伴有明显肌颤，机体活动能力几乎全部丧失。大部分病人仅能终日卧于床上，不能坐、站立，以轮椅代步，并伴有肌体或全身不同程度的代谢性水肿，吞咽及讲话困难，颈肌严重无力，头下垂，上肢可少许活动或仅有部分手指功能，但思维清晰。由于进食困难，造成病人严重的入量不足及消化吸收障碍，此期病人的脊椎及外围运动神经功能几乎全部损伤、破坏，肌细胞已无正常结构，医治较难，恢复缓慢。但亦有恢复迅速者。首先调其胃肠功能，快复正常进食，有力于病情的逆转和恢复。一般治疗1-2个月后可坐、站立，颈肌功能恢复，进食及舌肌功能改善。2-3个月可行走，肌肉开始增长，病情得到控制。在治疗和病情的恢复期间，需要注意营养配餐及入量，并配合适当的运动，将促进肌肉增长和功能的恢复。此期病人需经过6-12个月的治疗，才能进入巩固阶段。

对于病程一年左右的早期病人，神经肌电图仅表现为分支神经元，或部份肢体神经丛的电位及传等速度轻度延长。肌细胞活检仅出现梭型肌细胞变形或片状萎缩，少量坏死和再生纤维改变，－般横纹肌纤维基本正常。